ONE-RUN qPCR SĐSTEMĐ - 2X KATALOG NUMARALARI SAKLAMA KOŞULLARI SNPRQ2X-S (10 TEST) • Tüm bileşenler – 20°C de ve karanlıkta saklanmalıdır. SNPRTQ2X-1 (100 TEST) • Tüm bileşenler, ürün kutusunun üzerinde belirtilen son kullanma tarihine kadar kullanılabilir. SNPRTQ2X-5 (500 TEST) • SNPRTQ2X-10 (1000 TEST) Sürekli eritip çözdürmek, ürünün hassasiyetinde azalmalara neden olabilir. GĐRĐŞ One-run qPCR kiti, RNA ve DNA ile ilgili PCR çalışmalarına uygun olarak RNA VE DNA ĐÇĐN TAVSĐYE EDĐLEN PCR PROGRAMLARI RNA için; hazırlanmıştır. RNA için Revers transkripsiyon aşamasında, RNaz H 42 °C 30 dk. kullanılmaktadır. cDNA sentezlendikten sonra 95 C’de 10 dk bekletilerek 95 °C 10 dk. Hotstart Taq DNA polimeraz aktive edilmektedir. 95 °C 15 sn. Kit, DNA ile ilgili PCR çalışmalarına doğrudan cDNA sentez basamağı 60 °C 1 dk. aktivitesini düşürmek amacı ile tasarlanmış M-MLV revers transkriptaz o 35-45 döngü atlanarak kullanılmalıdır. DNA için; 95 °C 10 dk. öncelikle 95 °C 15 sn. komplementer DNA (cDNA) sentezine ihtiyaç duyulmaktadır. Bunun için ters 60 °C 1 dk. SĐSTEMĐN PRENSĐBĐ RNA molekülü ile gerçekleştirilen PCR çalışmalarında, 35-45 döngü transkriptaz (Revers Transcriptase) enzimi ile RNA’nın kalıbı oluşturulmakta ve elde edilen cDNA direk PCR işleminde kullanılabilmektedir. Kalıp olarak TEST PROSEDÜRÜ cDNA ve DNA’nın kullanıldığı 5' nükleaz testi için işlemin devamı Taq DNA 1 TEST ĐÇĐN; polimerazın 5’exonuclease aktivitesine dayanmaktadır. Bu test için probun • 12.5 µl qPCR Reaksiyon miks 5’ ucunda bir reporter boya ve 3’ ucunda da bir quencer boya • Primerler (Forward ve revers primerin her birinden 10 pmol) (*) bulunmaktadır. Quencer boya reporter boyanın ışımasını baskılamakta aynı • Prob 2,5 pmol (*) zamanda da probun primer gibi davranarak uzamasına engel olmaktadır. • RT/Hot Start Taq miks 0,25 µl PCR esnasında enzim aktivitesi ile birlikte reporter ve quencer arasında • Toplam RNA 1 – 5 µl DNA (1 – 100 ng) (*) bulunan prob parçalanarak ayrılır ve baskılanmanın ortadan kalkmasıyla • Toplam Hacim 25 µl olacak şekilde PCR Grade su ilave edilir. ışıma meydana gelir. Bu işlem sadece hedef bölge üzerinde hibridize olmuş • Hafifçe pipetlenerek karıştırılır. problarda gerçekleşir. Amplifikasyon miktarı arttıkça, • Tavsiye edilen PCR programı ile çalıştırılır. reporter boyanın açığa çıkmasıyla birlikte ışıma doğrusal olarak artmakta ve bu artış cihaz (*) Kit içeriğine dahil değildir. Konsantrasyonlar kullanıcıya ya da çalışmaya göre tarafından eş zamanlı olarak tespit edilmektedir. değişebilir. UYARILAR ÜRÜN ÖZELLĐKLERĐ Kit içerisinde bulunan Reverse Transcripase (M-MLV) 42-50°C’de, azaltılmış RNaz H aktivitesi ve 220 dakika yarılanma ömrü ile aktivite göstermektedir. HotStart Taq DNA Polimeraz enzimi, ısıya dayanıklılığı ve spesifikliği sağlayan Anti-Taq monoklonal antibodiler ve enzim bileşiminden oluşmaktadır. qPCR Reaction Miks her birinden 0.2 mM olmak üzere dNTP SĐSTEM ĐÇERĐĞĐ (*)Optimizasyon esnasında ihtiyaç duyulabilir. Saklama koşullarına uygun olarak saklanmalıdır. • Oda sıcaklığında unutulmuş PCR master miksleri kullanılmamalıdır. • PCR master miksi oda sıcaklığında tamamen eritilip, baş aşağı edilerek hafifçe karıştırıldıktan sonra tüplere bölünmelidir. • Master miksler tüplere bölündükten sonra Hot Start Taq DNA Polimeraz ve DNA eklenerek hemen PCR işlemine geçilmelidir. ve 2.5 mM MgCl2 içermektedir. Bileşen • qPCR Reaksiyon Miks (2X) • RT/Hotstart Taq Miks • 25 mM MgCl2 (*) • PCR Grade Su • 100 Test 2 x 650 µl 30 µl 1000 µl 500 µl • Belirtilenden fazla Hot Start Taq DNA Polimeraz koyulmamalıdır. • Yukarıda belirtilen PCR programı uygulanmalıdır. • PCR master miksleri vücut içinde kullanıma uygun değildir. Sadece belirtilen türlerin tespitinde vücut dışı test kiti olarak kullanılır. • PCR master mikslerin raf ömrü 6 aydır. Kullanmadan önce üretim tarihine dikkat edilmelidir. Düzenlenme Tarihi: 12.03.2012