Adı Soyadı: No BAÜ FEF 2. Öğretim 2011 Bahar Moleküler Biyoloji 2 Final Sınavı (06.06.2011) Süre 75dk’dır. 1. Normal Lac represörüne aşağıdaki DNA’lardan hangisi bağlanmaz? (2p) a) I+O+Z+ b) I+O+Z- c) I-O+Z+ d) I+OCZ+ e) hepsi bağlanır 11. cDNA hazırlarken revers transkriptaz ile oluşturulan tek zincirli DNA, DNA polimeraz I ile çift zincirli hale getirilirken bir primere neden ihtiyaç duyulmaz? (5p) 2. Trp operonu hakkında hangisi doğrudur? (2p) a) uyarılabilir ve negatif kontrol altındadır b) baskılanabilir ve negatif kontrol altındadır c) uyarılabilir ve pozitif kontrol altındadır d) baskılanabilir ve pozitif kontrol altındadır e) uyarılabilir ama kontrolü pozitif veya negatif değildir. 3. Ökaryotlarda DNA metilasyonu gen regülasyonunu nasıl yapar? (2p) a) DNA’daki CG ikililerine metil grupları ekleyerek b) RNA polimerazın aktivitesini değiştirerek c) tRNA’ları metilleyip translasyon aktivitesini değiştirerek d) DNA-DNA hidrojen bağlarını etkileyerek e) Guanin’leri metilleyerek 4. Ökaryotlarda gen regülasyon aşamalarını listeleyiniz (3p) 1. .. .. .. .. .. .. .. .. .. kontrol 2. .. .. .. . .. ... .. .. regülasyonu 3. .. .. .. .. regülasyonu 4. .. .. .. . .. ... .. .. .. .. regülasyon 5. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. regülasyon 6. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. regülasyonu 5. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. transkripsiyon faktörleridir (TF) ve bunlar direk olarak DNA’ya veya DNA’ya (promotöre) bağlı başka bir transkripsiyon faktörüne bağlanırlar. Örnek .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. ... (2p) 12. Bakteri genlerinin gen organizasyonu ile ökaryot genlerinin gen organizasyonlarını karşılaştırınız. Başlıca farklar nelerdir? (6p) 13. C. elegans 97 Mb’lık genomu ve yaklaşık 20000 geni olan ökaryot bir organizmadır. Maya ve Drosophila gibi diğer ökaryotlarla karşılaştırıldığında bu genomun hangi organizasyon özellikleri sıra dışıdır? (12p) 6. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .... promotöre bağlanmazlar, kromatinin açılarak promotörün (DNA’nın) histon proteinlerden uzaklaştırılmasını yani TF’lerin promotöre bağlanmasının engellerini kaldırmış olurlar. Örnek .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. ... (2p) 7. .. .. .. .. hücrenin G1’den S fazına geçisinde görevlidir. G1 fazı boyunca çekirdekteki pRB proteini, .. .. .. .. ile etkileşir ve onu inaktive eder. Hücre G1’den S fazına geçerken .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. kompleksi oluşur ve pRB’ye fosfat gruplarını ekler. pRB fosforillenince, .. .. .. .. .. .. serbest kalır, transkripsiyonel olarak aktive olur ve hücrelerin S fazına geçisine izin verir. (4p) 8. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. hücre bölünmesini teşvik etme veya sürdürülmesinde görev alırlar. Mutant durum (onkogenler), kontrolsüz hücre bölünmesini başlatır ya da devam ettirir (.. .. .. .. .. .. .. .. .. ..). Genellikle bu .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. anormal aktiviteli gen ürünlerinin artmasına ya da sürekli ortaya çıkmasına neden olur. Diğer taraftan .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. hücre döngüsü boyunca döngüyü durdurma görevi yapan .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. genler nedeniyle olur. Bu şekildeki genler mutant ise hücre döngüsünü durdurma kapasitelerini kaybederler. (5p) 9. Aşağıdaki DNA dizisinde bir restriksiyon enzimi tanıma bölgesi var mıdır? Varsa tanıma bölgesinde nükleotitleri yazınız. (5p) ATCGGTACTGGCACGTGTTT 14. Archaea genomları ile ökaryot genomların ortak özellikleri nelerdir? (9p) 15. Drosophila denge kromozomları nelerdir? ne gibi özelliklere sahiplerdir ve genetikçiler bu kromozomları ne amaçla kullanır? (8p) 10. Bir halkasal plazmit BamHI, NotI, XhoI ve PstII ile kesildiğinde 20kb uzunluğunda bir bant veriyor. İkili kesimlerde ise aşağıdaki bantlar elde ediliyor: BamHI + NotI: 15kb + 5kb Buna göre bu plazmitin restriksiyon PstI + NotI : 10kb haritasını çizerek gösteriniz. (15p) XhoI + PstI : 15kb + 5kb BamHI + XhoI: 10kb NotI + BglII: 10kb + 7.5kb + 2.5kb BamHI + BglII: 10kb + 7.5kb + 2.5kb PstI + BglII: 10kb + 7.5kb + 2.5kb 16. Genetik tamamlama analizi ve fonksiyonel tamamlama arasındaki fark nedir? (8p) 17. RNAi nedir ve nasıl çalışır? Araştırmacıların RNAi moleküllerini hücre içine gönderebilecekleri iki yöntem anlatınız. (10p)