260 PM 057 Taşlıdere (Batman) Sıcak Su

advertisement
19. Ulusal Biyoloji Kongresi
Karadeniz Teknik Üniversitesi, Biyoloji Bölümü, TRABZON
PM 057
Taşlıdere (Batman) Sıcak Su Kaynağından İzole
Edilen Anoxybacillus Cinsi Bakterinin Fosfolipit
Çeşitlerinin Analizi
Reyhan GÜL GÜVEN1, Annarita POLI2, Kemal
GÜVEN1, Barbara NICOLAUS2
1
Dicle Üniversitesi, Ziya Gökalp Eğitim Fakültesi,
Fen Bilgisi Ögretmenliği ABD, Diyarbakır
2
Istituto di Chimica Biomolecolare, CNR, via
Campi Flegrei n. 34, Pozzuoli, Napoli 80078 Italy
rgguven@dicle.edu.tr
Taşlıdere sıcak su kaynağı Batman ilinin
Kozluk ilçesine bağlı Şelmo nahiyesinin 7 km
kuzeybatısındadır. Su sıcaklığı 78°C ve Ph’sı 6.7
civarındadır. Bu çalışmada, bu kaynaktan izole
edilen ve morfolojik, fizyolojik, biyokimyasal ve
genetik analizler sonucunda Anoxybacillus cinsi
olduğu saptanan bakterinin lipit analizi (fosfolipit
çeşitleri ) ince tabaka tomografisi (TLC) ve sekiz
tane fosfolipit standardı kullanılarak tespit
edilmiştir.Araştırmada, bakterinin toplamda 6 tane
fosfolipit içerdiği ve TLC üzerinde görünen 3
bantın minör (1,3-sn-fosfatidil-rac-gliserol sodyum
klorür, 3-sn-fosfatidil L-serin (bovine brain), bir
tanesi de standartlara karşılık gelmediği, 3 bantın
ise majör olduğu (-rac-1,2, dipalmitol-gliserol-3fosfoetanolamine, DL-a-fosfoasidik asit dipalmitol)
bir tanesi de standartlara karşılık gelmediği tespit
edilmiştir.
Anahtar
Kelimeler:
fosfolipit,TLC,sıcak su kaynağı
Anoxybacillus,
PM 058
Taşlıdere (Batman) Sıcak Su Kaynağından İzole
Edilen Anoxybacillus ve Bacillus Cinsi
Bakterilerin Antibiyotiklere Dirençlilikleri
Reyhan GÜL GÜVEN1, Annarita POLI2, Kemal
GÜVEN1, Barbara NICOLAUS2, Erhan ÜNLÜ1
1
Dicle Üniversitesi, Ziya Gökalp Eğitim Fakültesi,
Fen Bilgisi Ögretmenligi ABD, Diyarbakır
2
Istituto di Chimica Biomolecolare, CNR, via
Campi Flegrei n. 34, Pozzuoli, Napoli 80078 Italy
rgguven@dicle.edu.tr
Taşlıdere sıcak su kaynağı Batman ilinin
Kozluk ilçesine bağlı Şelmo nahiyesinin 7 km
kuzeybatısındadır. Su sıcaklığı 78°C ve pH’sı 6.7
civarındadır.Bu çalışmada, bu kaynaktan izole
edilen ve morfolojik, fizyolojik, biyokimyasal ve
genetik analizler sonucunda Anoxybacillus ve
Bacillus
cinsi olduğu saptanan bakterilerin
antibiyotiklere dirençlilikleri 2 farklı yöntemle test
edilmiştir. Çalışmada 18 tane farklı antibiyotik
kullanılmıştır.Bu çalışmada Anoxybacillus cinsi
bakterinin Penisilin 2iu, Chloromfenicol 10 mcg,
Nystatin 100 iu, Ampicilin 25 mcg, Lincomiysin 15
mcg, Fusidik asit 10 mcg, ve Bacitrin 10 iu’a
dirençli olduğu aynı kaplıcadan izole edilen
Bacillus cinsi bakterinin ise yalnız Nystatin 100 iu
‘a dirençli olduğu tespit edilmiştir. Bacillus cinsi
bakterinin bu durumu dikkat çekicidir.
Anahtar Kelimeler : Antibiyotik, Anoxybacillus,
Bacillus
PM 059
Fındık Zararlısı Xyleborus dispar’dan İzole
Edilen Bacillus thuringiensis’e Ait cry3Aa (δendotoksin) Geninin Klonlanması,
Karakterizasyonu ve Ekspresyonu
Demet MERT1, Hatice KATI2, Kazım SEZEN1,
Zihni DEMİRBAĞ1, Remziye NALÇACIOĞLU1
1
Karadeniz Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat
Fakültesi, Biyoloji Bölümü, 61080, Trabzon
2
Giresun Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi,
Biyoloji Bölümü, 28100, Giresun
demetmert@ktu.edu.tr
Son yıllarda yapılan çalışmalar ve
gözlemler ürün veren kaynağı kurutarak verimi
azaltan ve fındık bahçelerinde yoğun olarak
bulunan Xyleborus dispar (Fabricius)’ın önemli bir
zararlı olduğunu göstermiştir. Dalkıran olarak
bilinen Xyleborus dispar (F.) (Coleoptera:
Scolytidae) polifag bir zararlıdır. Konukçuları
arasında fındıktan başka meyve ağaçlarından elma,
armut, erik, şeftali, kayısı, badem, kestane, vb. ile
gürgen, çınar, meşe, kavak, karaağaç, söğüt, kayın,
kızılağaç,
ıhlamur
gibi
orman
ağaçları
bulunmaktadır.
Daha önce yürütülen çalışmalarımızda
Karadeniz bölgesinde fındık ağaçlarından toplanan
Xyleborus dispar zararlısından bakteri izolasyonu
yapılmış ve izole edilen bu bakteriler arasında bir
tanesinin
Bacillus
thuringiensis
olduğu
belirlenmiştir.
Bu çalışmada Xyleborus dispar’dan izole
edilen B. thuringiensis’in, üniversal primerler
kullanılarak yapılan PCR analizi sonucunda, bu
bakterinin cry3 genini içerdiği tespit edildi. Yapılan
biyoassay çalışmaları sonucunda bakterinin
Coleoptera ordosuna ait olan Agelastica alni
larvaları üzerinde %100 öldürücü etkiye sahip
olduğu belirlendi. Genin ait olduğu cry3 alt
grubunu belirlemek için cry3 sınıfına ait daha özel
primerler kullanıldı ve genin kodlayan bölgesi
bütünü ile bakteri genomundan PCR ile çoğaltıldı.
Çoğaltılan gen PGEMT vektörüne klonlandı ve
dizin analizi yapıldı. Elde edilen sıranın
260
19. Ulusal Biyoloji Kongresi
literatürdeki cry3 genleri ile karşılaştırılması sonucu
bu bakteriye ait cry3 geninin Bacillus thuringiensis
subsp tenebrionis’in sahip olduğu cry3Aa ile %100
benzer olduğu belirlendi. Bu gen tarafından üretilen
proteini belirlemek için genin kodlayan bölgesi
ekspresyon vektörü pET28a’e klonlandı ve cry 3Aa
proteininin
ekspresyonu
gerçekleştirildi.
Ekspresyon vektörü tarafından ekspreslenen cry3Aa
proteini izole edildi ve SDS-PAGE analizi yapıldı.
Neticede 73 kDa’luk bir protein bandı belirlendi.
Böylece daha önce tanımlanan bu bakterinin
içermiş
olduğu
toksin
geninin
detaylı
identifikasyonu yapıldı. Sonuç olarak, Xyleborus
dispar’dan izole edilen ve detaylı identifikasyonu
yapılan B. thuringiensis’in, bakterideki insektisidal
toksininin veya toksin geninin zirai mücadele
amacıyla kullanılabileceği bu çalışma ile
belirlenmiş oldu.
Anahtar kelimeler: Bacillus thuringiensis, cry3Aa
δ-endotoksin, Xyleborus dispar, fındık zararlısı
PM 060
Halk Sağlığı Açısından Önem Arzeden Zararlı
Arthropodların Mücadelesinde Mikrobiyal
Pestisitlerin Kullanılma Olanakları
Engin KILIÇ1, Ömer Faruk ALGUR2, Mehmet
Nuri AYDOĞAN2, Salih DOĞAN3, Fatih SEZEK3
1
Doğu Anadolu Tarımsal Araştırma Enstitüsü,
Dadaşkent, Erzurum
2
Atatürk Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi,
Biyoloji Bölümü, Erzurum
3
Atatürk Üniversitesi, Kazım Karabekir Eğitim
Fakültesi, Biyoloji Eğitimi Anabilim Dalı, Erzurum
erzurumlue@hotmail.com
Günümüze kadar halk sağlığı açısından
önem arz eden zararlıların mücadelesi kimyasal
ilaçlarla yapılmış, özellikle II. dünya savaşından
sonra sentetik organik maddelerin sentezi ve
zararlılara karşı aşırı kullanımı sonucu, bu kimyasal
maddelerin birçok olumsuz etkileri ortaya çıkmıştır.
Bunun sonucu olarak zararlılarla mücadelede
kimyasal
mücadele
dışındaki
mücadele
yöntemlerine önem verilmeye başlanmış ve
biyolojik mücadele önem kazanarak zararlıların
doğal düşmanlarının tespiti ve biyolojik
mücadelede
kullanılma
olanaklarının
araştırılmasına ağırlık verilmiştir. Doğadaki
canlıların popülasyonları beslenme ilişkisinin
gereği olarak belirli bir dengede devam etmektedir.
Zararlı türler ile beslenen birçok canlı türü vardır.
İşte, bu canlılar, zararlıları baskı altında tutarak
popülasyon artışını sınırlamaktadırlar. Bu canlılara
doğal
düşman
adı
verilir.
Zararlıların
popülasyonlarını ekonomik zarar eşiğinin altında
tutmak
amacıyla,
zararlıların
predatörleri,
Karadeniz Teknik Üniversitesi, Biyoloji Bölümü, TRABZON
parazitoyitleri, patojenleri kullanılarak yapılan
mücadele çalışmalarına “Biyolojik Mücadele” adı
verilir. Halk sağlığı açısından önem arz eden zararlı
arthropodlara karşı insan ve çevreye dost
mikrobiyal pestisitlerin kullanımı günümüzde ön
plana
çıkmıştır.
Mikrobiyal
pestisitler
entomopatojenlerden elde edilir. Entomopatojenler
parazit mikroorganizmalar olup konukçularının
ölümüne sebep olurlar. Ölen konukçu binlerce
mikroorganizmayı etrafa dağıtır. Özellikle, rüzgar
ve yağmurun etkisiyle yayılma alanı geniş alanları
kapsar. Patojenlerin, konukçu içerisinde çok hızlı
çoğalmaları ve küçük cesametli olmaları sebebiyle
kitle halinde üretimleri kolay olmaktadır.
Zararlılarla mücadelede; fungus, bakteri, virüs ve
protozoonların bizzat kendileri, öldürülmüş formları
veya
üretmiş
oldukları
metabolitlerden
yararlanılmaktadır. Dünyada giderek artan çevre
bilinci, sentetik pestisitlerin insan ve çevre sağlığına
olumsuz etkileri, doğal dengenin bozulması gibi
sebepler sonucu son yıllarda mikrobiyal pestisitler
üzerinde daha yoğun çalışmalar yapılarak birçok
biyopreparatın
piyasaya
verilmesine
sebep
olmuştur. Günümüzde kullanılan mikrobyial
pestisitlerden, 104 bakteri, 44 nematod, 12 fungus,
8 virüs ve 6 protozoon preparatının bulunduğu
belirtilmektedir. Keza insan sağlığı açısından önem
arz eden böcek ve akarların mücadelesinde
entomopatojen bakterilerden Bacillus thringiensis,
funguslardan Beauveria bassiana ve virüslerden ise
baculovirüsler kullanılmaktadır. Bu çalışmada insan
sağlığını tehdit eden böcek ve akarlar belirtilmiş ve
bu zararlılarla mücadelede entomopatojenlerin
kullanılma imkanları literatür ışığında tartışılmıştır.
Anahtar Kelimeler: İnsan sağlığı, zararlı böcek ve
akarlar, biyolojik mücadele, mikrobiyal pestisitler
PM 061
Lymantria dispar (Lepidoptera:
Lymantriidae)’dan elde edilen bakterilerin
identifikasyonu
İsmail DEMİR1, Kadriye ÖZCAN1, Hacer
MURATOĞLU1, Agah İkbal İNCE2, Zihni
DEMİRBAĞ1
1
Karadeniz Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat
Fakültesi, Biyoloji Bölümü, 61080, Trabzon
2
Giresun Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi,
Biyoloji Bölümü, Giresun
idemir@ktu.edu.tr
Bir orman zararlısı olan Lymantria dispar,
başta meşe olmak üzere birçok geniş yapraklı
orman ağacında zarar oluşturmaktadır. Ayrıca,
elma, armut, erik, kayısı, kestane ve fındık gibi
birçok meyve ağacında zararlar meydana getirerek
önemli ürün ve ekonomik kayıplara neden olurlar.
261
Download