2- ece klif 3- 4- HAcErrEpE iiNivEJ;?Esi nexronlUGti Bilimsel Aragttrma Projeleri Koordinasyon burundugum FHD-2016_e727 r Menke) Filoco$rafiaJr"^tasrrk]r-;;;'i:oJ"'' ^]::T::r* nususunda gere$ini arz ederim. ve 'Ak Bi'mi Koordinat6rrtigrine Kavaqritri nrin (Noccaea iberidea (Boiss) "-'-amtnda aga$rdaki sitrnarma/h.i""il"isr"';r"rinin .. Ar9.Gdr. ennrg OzUoOGnU l_pNfu #Nnuoo, 6P% Arshehbaz gerg*kregtirirmesi 28.07.2016 TAQ DNA POLYMERASE TEKNIK $ARTNAMESI 1'Enzim standart Taq,DNA polimeraza g6re 2 kat dahafazla iiriin verebilmeli ve hedef amplikon uzunlugu <6kb olmahdrr. 2.Enzim, hem 3' ,hemde 5' exonuclease aktivitesi gdstermelidir. 5') 3') 3. Urun 200 reaksiyonluk olmahdrr. 4.Master mix igeripinde agagrdaki soltisyonlar burunmahdrr: Taq DNA polimerase (15 U/pl) 2x green buffer . o o o 0,4,er mM dATp, dCTp, dTTp, dGTp 4 mM MgCl2 5' Green buffer sayesinde elde edilen PCR iiriinleri 6x loading dye ile mix yapmaya gerek kalmadan direk j ele ytiklenebilmelidir. 6' Kaliteli PCR iiriinii elde etmek igin green buffer'm pcR igin optimize edilmig tescilli formtlasyonu olmahdrr. entleri yiiriimeli ve yellow dye ile r ytiriimelidir. m ve 615 nm olmahdrr. syon sUresi yeterli olmahdrr. e 3-4 dakika uzatrlabilmelidir. astndan 5oc daha dtigiik olmahdrr ve baslanma igin 30 saniye yeterri olmahdrr. l2'Enzim igin optimumuzatmasrcakhsr 70-75"Colmahdrr. Onerilen uzatmaadrmr 2 kb PCR i.iriinti igin72"C, de 1 dakika olma-hdrr. 13: Kahp DNA'dan 10 pg- 1pg, pcR master mix'den 25 pr ,F-primer,den 0.1- 1 pM, Rprimer'den 0.1- I pM kullanrlarak total hacim : o pr oracak irtito. pcR mix,i hazrrlanmahdr. 11 DNA fragmentlerinin rutin PCR amplifikasyonu genomik DNA,dan 6kb, viral DNA,dan 20 kb kadar olmaldrr. Jl'f'T-ncr, genotipleme ve TA klonlama igin PCR tiriinlerinin iiretiminde kullanrlabilnnelidir. l6'Enzim ambalajr tizerinde son kullanmaiarihigoriilebilir olmal, ve bu stire l(bir) yrl<tan fazla olmahdrr. lT.Teslimatl l zincir ortammda yaprlmahdrr. l8.i.stenildiS rgr green buffer ahnabilmelidir. l9.Uriin 200 tOOl reaksiyonluk olarak ahnabilmelidir. Arag.Gtir. Dr. Barrg Oziidofru 28.0'7.2016 1' Kit bitki 2. 3. 4' 5. doku ve bitki hiicrelerinden veya mantar orneklerinden total hiicresel DNA izolasyonu yapabilmelidir. Kit protokolti organik ektiaksiyona ve alkol prespitasyonuna gerek duymamahdrr. Protokol bir saatten daha krsa bir siirede tamamlanmahdrr. Protokole baqlama materyalinin maksimum hacmi rslak alrrhkla 100m61 veya kuru alrrhkla 20mg olmahdrr. Elusyon oraruna balh olarak 3 pg-30 pg konsantrasyonda DNA elde edebilmelidir. Kit silika membran bazh spin kolon prosedtirti ile gahgmahdrr. 6. 7. Kitin saklama kogullarr oda srcakhgrnda muh'afaza edilmeye uygurr olmahdrr. 8. Kit kolonlar ve elAshredder Mini spin rektirdigi miktarda 2 mI lik toplama kol tup 9' Kit igerisinde test miktarr kadar bulunan spin kolanlar tek tek steril amb alaj i geris inde o lmah drr. 10.Kit RNase A igermelidir" ll.Izolasyon ile 40 kb kadar elde edilen DNA, PCR, Real-time PCR ve multipleks PCR uygulamalannda, RAPD ve mikrosatellit analizi gahqmalarrnda, RFLP, AFLP ve Southern blotting gahgmalarrnda kullanrlmaya uygun olmahdrr. 12'Teklif veren firmalar tiretici firmanm tek yetkiti temsilcisi olmahdrr veya Ti'irkiye' de tek yetkili distribritdrii tarafindan yetkilendirilmig olmaldrr. l3.Teklif verecek firmalarrn tiriine ait ISo134g5 ve TURKAK onayh belgeleri olmahdrr. l4,Kit, laboratuvar ortamrnda demosu yaprhp,onayr verildikten sonra de$erlendirmeye almacaktr. Arag.Giir. Dr. Bang Oziidolru 28.07.2016 Mikropipet ucu filtresiz 10 pl teknik gartnamesi o o o 1000'lik pogeflerde filtresiz olmalrdrr. 0'2-2ltl, 0.5-1Opr, BUtun ana pipetlerle mUkemmel uyum gostermeli ozellikle Finnpipet uzun ve ' ' 1-1Opr ararrkrarda gekim yapabirmeridir. dijital formlardaki pipetlerle ve Pipetman pipetiyle uyumlu olmalrdrr. DNAase, RNAase, pyrogen, RNA, DNA'dan yoksun ormarrdrr. De5erlendirme numuneler laboratuva nmtza teslim edilecektir, UrUnler test edild ikten sonra laboratuvart m tz tarafr ndan de$erlendirmeye al r nacaktr r. Arag.Gdr. Dr. Barrg OzUdogru 28.07.2016 Mikropipet ucu filtresiz 1000 pl teknik gartnamesi 1. 1000'lik pogeflerde filtresiz olmalrdrr. 2. 100-1000 trrt aralrklarda gekim yapabilmelidir. 3' Butun ana pipetlerle mukemmel uyum gostermeli ozellikle Finnpipet uzun ve dijital formlardaki pipeilerle ve pipetman pipetiyle uyumru olmalrdrr. 4. DNAase, RNAase, pyrogen, RNA, DNA,dan yoksun olmalrdrr. 5. De$erlendirme numuneler laboratuvarr m rza teslim edilecektir. Urunler test edild ikten sonra laboratuvarr m rz tarafrndan de$errendirmeye ar nacaktr r. r Arag.GOr. Dr, Barrg OzUdogru 28.07.201ti Mikropipet ucu filtresiz 200 gl teknik gartnamesi o . o 1000'lik pogeflerde filtresiz olmahdrr. 20-200p1 arahklarda gekim yapabilmelidir. Butun ana pipetlerle mukemmel uyum gdstermeli Ozellikle Finnpipet uzun ve dijital formlardaki pipeflerle ve pipetman pipetiyle uyurrlu olmalrdrr. o DNAase, RNAase, pyrogen, RNA, DNA,dan yoksun olmalrdrr. ' De0erlendirme numuneler laboratuva nmtza teslim edilecektir. UrUnler test edildikten sonra laboratuvarrmrz tarafrndan de$erlendirmeye alrnacaktrr. Arag.GOr. Dr. Barrg OzUdogru 28.07.2016 DNA Ladder urun 100 bp uzunlugunda 1b00 bp ye kadar yaklagrk 15 fragment igermetidir. Arag.GOr. Dr. Bang OzUdo$ru