Günay Günaydın Çanakkale'de doğdu. 1984 yılında girdiği Gazi Üniversitesi, Gazi Eğitim Fakültesi, Müzik Eğitimi Bölümü’nden 1988 yılında mezun oldu. Aynı yıl Hacettepe Üniversitesi Devlet Konservatuvarı’nda kurulmuş olan Müzikoloji Bölümü, Etnomüzikoloji ve Folklor Anabilim Dalı’na girerek ikinci üniversite yaşamına başladı. Halil Erdoğan Cengiz ve Orhan Şaik Gökyay ile Osmanlıca ve Osmanlı Kültürü üzerine çalışmıştır. Bu bölümü 1992 yılında birincilikle bitirdi ve Araştırma Görevlisi olarak akademik yaşamına başladı. Müzik Eğitiminde Terimler Sözlüğü (1988), Osmanlı hareminin sonunun anlatıldığı Haremin Son Gülleri (2006), Kamer Çerileri (2008), Esrâr-ı Aşk (2011), Karaşar (2011) ve Nağme-i Cihân (2014) isimli kitapları, çeşitli dergi ve gazetelerde etnomüzikoloji ile ilgili yazıları vardır. Müzik ile ilgili ulusal ve uluslar arası kongre ve sempozyumlara katılmış, çok sayıda panelde konuşmacı olarak yer almıştır. Osmanlı Haremi, Osmanlı Hareminde Müzik Eğitimi, Osmanlı’dan Günümüze Müzik gibi konularda da çok sayıda konferans vermiştir. Halen Hacettepe Üniversitesi, Devlet Konservatuvarı, Müzikoloji Bölümü\'nde Öğretim Görevlisi olan Günay Günaydın; Geleneksel Türk Müzikleri Teorisi, Geleneksel Türk Müzikleri Tarihi, Müzikoloji Semineri ve Osmanlı Sarayında Eğitim ve Müzik derslerini vermekte, ayrıca yazarlık çalışmalarını da sürdürmektedir.