XV. Ulusal Kimya Kongresi, İstanbul, 2001 FK

XV. Ulusal Kimya Kongresi, İstanbul, 2001
FK-S3
ANTİTÜMÖR FENİLKİNOLİN-8-KARJBOKSAMİD MOLEKÜLÜNÜN
MOLEKÜLER MEKANİK İNCELENMESİ
Rıza Abbasoğlu1,2, Sevil Savaşkan Yılmaz1
1Karadeniz Teknik Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi Kimya Bölümü 61080 Trabzon
2Azerbaycan Teknoloji Üniversitesi, Gence-Azerbaycan
Giriş
Antitümör fenilkinolin~8 -karboksamidin(FKK) izomerleri DNA molekülüyle interkolasyon
mekanizması ile moleküler-steking kompleks oluştururlar ve antitümör özelliği gösterirler(l). Bu
komplekslerin kararlılığını ve molekülün DNA’e bağlanma sabitini (logK) etkileyen faktörlerin
başında FKK molekülünün geometrik özellikleri gelir.
Yöntem
Bu çalışmada n-fenilkinolin-8 -karboksamidlerin (n= 2, 3, 4, 5, ve 6 ) konformasyon analizi OLPS
moleküler mekanik yöntemiyle yapıldı ve geometrik özellikleri incelendi. Her bir molekülün kararlı
konformasyonu belirlendi, gerilim enerjisi (E), fenil halkasının kinolin düzlemi ile oluşturduğu
dehedral açı(<p) ve fenil grubunun iç dönme engel eneıjisi (AE) hesaplandı. Bütün hesaplamalar
HYPERCHBM 6.0 programı ile yapıldı. Sonuçlar Tablo 1 de yeralmaktadır.
loe K (l)
Molekül
2
3
4
5
6
E(kcal/mol)
8.65
10.93
14.97
15.23
11.14
(p(derece)
18.04
25.82
46.36
48.80
2 0 .0 1
AE(kcal/mol)
0.35
1.34
8 .0 2
7.99
0.31
AT
GC
5.97
5,68
4.73
4.74
5.92
5.70
4.77
4.79 ■
5.96
6 .1 2
Sonuçlar
1. Molekülde fenil grubunun iç dönme engel eneıjisi ile molekülün DNA’ e bağlanma sabiti arasında
bir korelasyon söz konusudur.
2. 2-, 3-, 6 - fenil izomerlerinde fenil grubunun iç dönme engel eneıjisi düşüktür. Bu izomerlerde
fenil ve kinolin halkalarının koplanar konumda yer almalan eneıji bakımından uygundur. Dolayısı ile
bu moleküllerin kromofor kısmının, fenil-kinolin gruplaşmasının, DNA molekülünün iç boşluğunun
simetri düzlemlerine (azot bazlarının düzlemlerine) koplanar yönelmesi ve molekülün DNA ile
kuvvetli bağlanması mümkündür.
3. 4- ve 5- fenil izomerlerinde, fenil grubunun iç dönme engel eneıjisi fazladır ve bu esasen, fenil
grubunun orto ve kinoîinin peri hidrojenlerinin etkileşmesinden kaynaklanır. Bundan dolayı
molekülün kromoforunun fenil kısmı DNA’ in iç boşluğuna yerleşmez ve molekül DNA ile zayıf
bağlanır, hemen hemen antitümör özellik.göstermez.
Kaynaklar
(1) Atwell G.JJBos C.D., Baguley B.C., Denny W. A., J.Med. Chem., 1988, 31,1048.