T.C. ESKİŞEHİR OSMANGAZİ ÜNİVERSİTESİ REKTÖRLÜĞÜ İDARİ VE MALİ İŞLER DAİRE BAŞKANLIĞI BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ SATINALMA ŞUBE MÜDÜRLÜĞÜ Sayı Konu GÜNLÜDÜR 13/02./2015 ESKİŞEHİR : 59348463-604-99 [SP.2.10]392 : Doğrudan Temin Teklif Belgesi 4734 sayılı KİK.nun 3. Md.nin (f) bendi uyarınca yürütülen ve desteklenen araştırma-geliştirme projeleri için gerekli mal ve hizmetlerin alımları için düzenlenen esas ve usüllerin (21/d) Md.ne göre doğrudan temin usûlü ile alımı yapılacak olan aşağıda cins ve miktarı yazılı malzemeler / cihazlar için KDV Hariç tekliflerinizi en geç 19 / 02 / 2015 saat 16.30’a kadar aşağıdaki bilgiler dâhilinde Üniversitemiz Bilimsel Araştırma Projeleri Satınalma Birimine vermenizi rica ederim. Ali KANBER İdari ve Mali İşler Şube Müdürü S.No. Malın/Hizmetin Cinsi 1 DNA İzolasyon Kiti 2 3 4 5 6 7 4 Çift Primer Taq DNA Polimeraz Enzimi dNTP Miks Mfeı (MunI) restriksiyon enzimi Alu Restrüksiyon enzimi DNA Ladder Miktarı Birim Fiyatı Toplam Tutar 250+50 reaksiyonluk 8 adet 15adet 2 adet 8 adet 8 adet 1 adet KDV ORANI % % % % % % % NOT: TEKNİK ŞARTNAMESİ VARDIR (Şartnameler 0222 239 37 50 / 5529-5526’den temin edilebilir) NOTLAR: 2015/11D05 kod nolu proje için, teklifler 19 /02 / 2015 saat 16.30’a kadar ESO.G.Ü.Bilimsel Araştırmalar Birimi Satın alma Servisine elden veya kargo ile getirilmelidir. Teklif mektubuyla beraber teknik şartnameye cevaplar ile katalog, broşür vb. belgeler verilmelidir. (FAX İLE GÖNDERİLEN TEKLİFLER DEĞERLENDİRİLMEYE ALINMAYACAKTIR.) _Siparişin sonrasında malzemelerin kaç günde teslim edileceği belirtilecektir. KISMİ TEKLİF VERİLEBİLİR. ALTERNATİF TEKLİF VERİLMEYECEKTİR. Teklif edilen cihazların markaları ve modelleri teklif mektubunda ayrıntılı olarak belirtilmelidir. katalog, broşür bilgilerinden birbirini teyit etmeyen ve yukarıdaki şartları taşımayan teklif mektupları değerlendirmeye alınmaz. Malzemeler İdari ve Mali İşler Daire Başkanlığına bilgi verilerek, TESLİMATLARI ELDEN DEPOYA YAPILACAKTIR. KARGO İLE YAPILAN TESLİMATLAR KABUL EDİLMEYECEKTİR Malzeme Teslim İrtibat Numarası:0222 239 59 56 -0222 239 37 97- 0222 239 37 50 /5501 İdari bilgi için= Tel: 0 222 239 37 50-5526-5529 Fax: 0 222 239 39 03 _ Teknik Bilgi İçin: DAHİLİ TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ TIBBİ GENETİK ANABİLİM DALI Yrd.Doç.Dr.Hüseyin ARSLAN-222-239 59 69/4440 Adres:Meşelik Kampüsü-ESKİŞEHİR Tel:0.222.2393750-5526-5529 Fax:0.222.2393903 Bil.Arş Prj. Satınalma Şubesi – 1. DNA İzolasyon Kiti Teknik Özellikleri: • Kit Kan,doku,hücre,bakteri,swabs,kan lekeleri gibi geniş örnek tiplerinden yüksek saflıkta genomik DNA izolasyonunu gerçekleştirebilmelidir. • Kit Spin kolon yöntemi ile çalışmalıdır. • Kit ile 250 + 50 Test çalışılabilmelidir. • 100 ul den 1 ml'ye kadar miktarlardaki örneklerden DNA 'yı izole edebilmelidir. • Kit içeriğinde spin kolon,örnek toplama tüpleri,digestion buffer,wash buffer,elution buffer,lysis/binding buffer,proteinase K, RNase A bulunmalıdır. • Kitin oda ısısında saklanabilmelidir. Uygun koşullarda saklandığı takdirde bir yıl raf ömrü olmalıdır. 2. 4 Çift Primer Teknik Özellikleri: 1. Primerler HPLC saflıkta, 200 nmol olmalıdır 2. Primerlerin transferi saklama koşullarına uygun olarak +4 oC de yapılarak kullanıcıya teslim edilmelidir. 3. primerler ile birlikte dilüsyon oranlarını gösteren belge mutlak verilmelidir. 3. Taq DNA Polimeraz Enzimi Teknik Özellikleri: 1.Enzim ,thermophilic bacteri olan Thermus aquatıcus suşhundan elde edilmiş olmalıdır. 2.Enzim,hem 5' 3' ,hemde 3' 5' exonuclease aktivitesi göstermelidir. 3.Konsantrasyonu 5Ü/ ul ,ambalaj şekli 500Ü şeklinde olmalıdır. 4.Enzim ile birlikte aşağıdaki solüsyonlar teslim edilmelidir. - 3adet 1ml lik 10X Taq Buffer Potasıum Chlorıdeli KCl - 3adet 1ml lik 10X Taq Buffer Ammonıum sülfatlı (NH4)2 SO4 - 3adet 1ml lik 25 mM lık Magnesıum chlorıde MgCl2 Ammonum sülfat solusyonlu 10X Taq buffer lar elektroforez sırasında oluşabilecek bant kaymalarını(smilling) önlediği ve bantların temiz ve net çıkmasını sağladığı için özellikle tercih edilmektedir. 5.Enzim ambalajı üzerinde son kullanma tarihi görülebilir olmalı ve bu süre 1(bir) yıldan fazla olmalıdır. 6.Teslimatlar (-20C ) soğuk zincir ortamında yapılmalıdır. 7.Enzim ile teslim edilecek buffer içerikleri aşağıdaki gibi olmalıdır. 10X Taq buffer with KCI : 100mM Tris HCI (PH :8.0 25 C de ) ,500mM KCI 0.8% Nonidet P40 10X Taq buffer with ( NH4)2 SO2 : 750mM Tris HCI (PH : 8.8 25C de ) , 200mM (NH4)2 S04 ,0.1% Tween 20 4. dNTP Miks Teknik Özellikleri: 1.Tüm deoxyribonucleaselar( dATP,dGTP,dCTP,dTTP ) tek tüpte karışık halde olmalıdır. 2.Karışım konsantrasyonu 10mM olmalıdır. 3.Karışım hacmi 5x1000ul (5x1ml) olmalıdır. 4.Formülünde Na(Sodıum) tuzu bulunmamalıdır. 5.Purifikasyonu HPLC ile % 99 verimlilikte yapılmış olmalıdır. 6.Teslimatlar (-20C ) soğuk zincir ortamında yapılmalıdır. 5. Mfeı (MunI) restriksiyon enzimi Sarf Malzemesi Teknik Özellikleri: 1- Bir tüp 50 ul'lik enzim içermelidir. 50ul enzim ile 50 reaksiyon yapılabilmelidir. 2- Enzim ile birlikte loading dye içeren renkli bir buffer ve renksiz bir buffer olmak üzere iki adet buffer gelmelidir. 3- Enzim bu bufferlar içerisinde %100 aktif olmalıdır. 4- Bufferların her biri 1 ml ve 10X konsantrasyonda olmalıdır. 5- İnkübasyon 37ºC de olmalıdır. 6- 1 ul enzim; 1ug lambda DNA' yı 15 dakikada 1ug plazmid DNA' yı 15 dakikada 0,2 ug PCR ürününü 15 dakikada 1 ug genomik DNA' yı 15 dakikada ya da 5 ug genomik DNA'yı 60 dakikada kesebilmelidir. 7- Enzim 16 saatlikbir inkübasyonda star aktivitesi göstermemelidir. 8- Enzim, 65 ºC' de5 dakikalık bir inkübasyonla inaktive olmalıdır. 9- Enzim -20 ºC' de saklanmalıdır. 6. Alu Restrüksiyon enzimi Teknik Özellikleri: 1- Bir tüp 100 ul'lik enzim içermelidir. 100 ul enzim ile 100 reaksiyon yapılabilmelidir. 2- Enzim ile birlikte loading dye içeren renkli bir buffer ve renksiz bir buffer olmak üzere iki adet buffer gelmelidir. 3- Enzim bu bufferlar içerisinde %100 aktif olmalıdır. 4- Bufferların her biri 1 ml ve 10X konsantrasyonda olmalıdır. 5- - İnkübasyon 37ºC de olmalıdır. 6- 1 ul enzim; 1ug lambda DNA' yı 15 dakikada 1ug plazmid DNA' yı 15 dakikada 0,2 ug PCR ürününü 15 dakikada 1 ug genomik DNA' yı 15 dakikada ya da 5 ug genomik DNA'yı 60 dakikada kesebilmelidir. 7- Enzim 16 saatlikbir inkübasyonda star aktivitesi göstermemelidir. 8- Enzim, 65 ºC' de5 dakikalık bir inkübasyonla inaktive olmalıdır. 9- Enzim -20 ºC' de saklanmalıdır. 7. DNA Ladder Sarf Malzemesi Teknik Özellikleri: 1. 100 bp DNA Ladder, kullanıma hazır 50µg 2. 6X Orange yükleme boya çözeltisi ile birlikte verilmelidir. 3. Yükleme tamponu; 10 mM Tris-HCl (pH 7.6), 10 mM EDTA, % 0.025 orange G, %0.005 ksilen siyanol FF ve % 10 gliserol içermelidir. 4. 6X Orange DNA yükleme boyası 10 mM Tris-HCl (pH 7.6), % 0.15 orange G, % 0.03 ksilen siyanol FF, 60% gliserol ve 60 mM EDTA içermelidir. 5. Agaroz ya da poliakrilamid jelde çift zincirli DNA fragmanlarını geniş aralıkta ayrımlamalı ve ölçmelidir. Ladder, kromatografi ile saflaştırılmış, tek tek, 1000, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200, 100 bp'lik DNA fragmanlarından oluşmalıdır, tek referans bandından (500 bp) oluşmalıdır. 6. Direkt jel yüklemesi için 6X Orange yükleme boya çözeltisi ile karıştırılmış olmalı ve kullanıma hazır olarak gelmelidir. 7. Keskin bantlar oluşmalıdır. 8. Referans bantları parlak olmalıdır. (kırmızı renkle gösterilen gibi) 9. Jele direkt yüklenebilmelidir ve oda sıcaklığında 6 ay stabil kalabilmelidir. Yrd.Doç.Dr.Hüseyin ARSLAN 1. DNA İzolasyon Kiti Teknik Özellikleri: • Kit Kan,doku,hücre,bakteri,swabs,kan lekeleri gibi geniş örnek tiplerinden yüksek saflıkta genomik DNA izolasyonunu gerçekleştirebilmelidir. • Kit Spin kolon yöntemi ile çalışmalıdır. • Kit ile 250 + 50 Test çalışılabilmelidir. • 100 ul den 1 ml'ye kadar miktarlardaki örneklerden DNA 'yı izole edebilmelidir. • Kit içeriğinde spin kolon,örnek toplama tüpleri,digestion buffer,wash buffer,elution buffer,lysis/binding buffer,proteinase K, RNase A bulunmalıdır. • Kitin oda ısısında saklanabilmelidir. Uygun koşullarda saklandığı takdirde bir yıl raf ömrü olmalıdır. 2. 4 Çift Primer Teknik Özellikleri: 1. Primerler HPLC saflıkta, 200 nmol olmalıdır 2. Primerlerin transferi saklama koşullarına uygun olarak +4 oC de yapılarak kullanıcıya teslim edilmelidir. 3. primerler ile birlikte dilüsyon oranlarını gösteren belge mutlak verilmelidir. 3. Taq DNA Polimeraz Enzimi Teknik Özellikleri: 1.Enzim ,thermophilic bacteri olan Thermus aquatıcus suşhundan elde edilmiş olmalıdır. 2.Enzim,hem 5' 3' ,hemde 3' 5' exonuclease aktivitesi göstermelidir. 3.Konsantrasyonu 5Ü/ ul ,ambalaj şekli 500Ü şeklinde olmalıdır. 4.Enzim ile birlikte aşağıdaki solüsyonlar teslim edilmelidir. - 3adet 1ml lik 10X Taq Buffer Potasıum Chlorıdeli KCl - 3adet 1ml lik 10X Taq Buffer Ammonıum sülfatlı (NH4)2 SO4 - 3adet 1ml lik 25 mM lık Magnesıum chlorıde MgCl2 Ammonum sülfat solusyonlu 10X Taq buffer lar elektroforez sırasında oluşabilecek bant kaymalarını(smilling) önlediği ve bantların temiz ve net çıkmasını sağladığı için özellikle tercih edilmektedir. 5.Enzim ambalajı üzerinde son kullanma tarihi görülebilir olmalı ve bu süre 1(bir) yıldan fazla olmalıdır. 6.Teslimatlar (-20C ) soğuk zincir ortamında yapılmalıdır. 7.Enzim ile teslim edilecek buffer içerikleri aşağıdaki gibi olmalıdır. 10X Taq buffer with KCI : 100mM Tris HCI (PH :8.0 25 C de ) ,500mM KCI 0.8% Nonidet P40 10X Taq buffer with ( NH4)2 SO2 : 750mM Tris HCI (PH : 8.8 25C de ) , 200mM (NH4)2 S04 ,0.1% Tween 20 4. dNTP Miks Teknik Özellikleri: 1.Tüm deoxyribonucleaselar( dATP,dGTP,dCTP,dTTP ) tek tüpte karışık halde olmalıdır. 2.Karışım konsantrasyonu 10mM olmalıdır. 3.Karışım hacmi 5x1000ul (5x1ml) olmalıdır. 4.Formülünde Na(Sodıum) tuzu bulunmamalıdır. 5.Purifikasyonu HPLC ile % 99 verimlilikte yapılmış olmalıdır. 6.Teslimatlar (-20C ) soğuk zincir ortamında yapılmalıdır. 5. Mfeı (MunI) restriksiyon enzimi Sayfa 22Proje Kodu: 2014-603 Sarf Malzemesi Teknik Özellikleri: 1- Bir tüp 50 ul'lik enzim içermelidir. 50ul enzim ile 50 reaksiyon yapılabilmelidir. 2- Enzim ile birlikte loading dye içeren renkli bir buffer ve renksiz bir buffer olmak üzere iki adet buffer gelmelidir. 3- Enzim bu bufferlar içerisinde %100 aktif olmalıdır. 4- Bufferların her biri 1 ml ve 10X konsantrasyonda olmalıdır. 5- İnkübasyon 37ºC de olmalıdır. 6- 1 ul enzim; 1ug lambda DNA' yı 15 dakikada 1ug plazmid DNA' yı 15 dakikada 0,2 ug PCR ürününü 15 dakikada 1 ug genomik DNA' yı 15 dakikada ya da 5 ug genomik DNA'yı 60 dakikada kesebilmelidir. 7- Enzim 16 saatlikbir inkübasyonda star aktivitesi göstermemelidir. 8- Enzim, 65 ºC' de5 dakikalık bir inkübasyonla inaktive olmalıdır. 9Enzim -20 ºC' de saklanmalıdır. 6. Alu Restrüksiyon enzimi Teknik Özellikleri: 1- Bir tüp 100 ul'lik enzim içermelidir. 100 ul enzim ile 100 reaksiyon yapılabilmelidir. 2- Enzim ile birlikte loading dye içeren renkli bir buffer ve renksiz bir buffer olmak üzere iki adet buffer gelmelidir. 3- Enzim bu bufferlar içerisinde %100 aktif olmalıdır. 4- Bufferların her biri 1 ml ve 10X konsantrasyonda olmalıdır. 5- İnkübasyon 37ºC de olmalıdır. 6- 1 ul enzim; 1ug lambda DNA' yı 15 dakikada 1ug plazmid DNA' yı 15 dakikada 0,2 ug PCR ürününü 15 dakikada 1 ug genomik DNA' yı 15 dakikada ya da 5 ug genomik DNA'yı 60 dakikada kesebilmelidir. 7- Enzim 16 saatlikbir inkübasyonda star aktivitesi göstermemelidir. 8- Enzim, 65 ºC' de5 dakikalık bir inkübasyonla inaktive olmalıdır. 9- Enzim -20 ºC' de saklanmalıdır. 7. DNA Ladder Sayfa 23Proje Kodu: 2014-603 Sarf Malzemesi Teknik Özellikleri: 1. 100 bp DNA Ladder, kullanıma hazır 50µg 2. 6X Orange yükleme boya çözeltisi ile birlikte verilmelidir. 3. Yükleme tamponu; 10 mM Tris-HCl (pH 7.6), 10 mM EDTA, % 0.025 orange G, %0.005 ksilen siyanol FF ve % 10 gliserol içermelidir. 4. 6X Orange DNA yükleme boyası 10 mM Tris-HCl (pH 7.6), % 0.15 orange G, % 0.03 ksilen siyanol FF, 60% gliserol ve 60 mM EDTA içermelidir. 5. Agaroz ya da poliakrilamid jelde çift zincirli DNA fragmanlarını geniş aralıkta ayrımlamalı ve ölçmelidir. Ladder, kromatografi ile saflaştırılmış, tek tek, 1000, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200, 100 bp'lik DNA fragmanlarından oluşmalıdır, tek referans bandından (500 bp) oluşmalıdır. 6. Direkt jel yüklemesi için 6X Orange yükleme boya çözeltisi ile karıştırılmış olmalı ve kullanıma hazır olarak gelmelidir. 7. Keskin bantlar oluşmalıdır. 8. Referans bantları parlak olmalıdır. (kırmızı renkle gösterilen gibi) 9. Jele direkt yüklenebilmelidir ve oda sıcaklığında 6 ay stabil kalabilmelidir.